En Egipto también hubo epidemias de peste, como nos cuentan varios documentos históricos.
Bajo el reinado de Akhenatón se ha localizado un fuerte brote de una epidemia de peste negra. En ese momento de la historia, un ejército egipcio cayó derrotado por las tropas del rey del rey hitita Suppiluliuma y, según las fuentes, "
cuando los prisioneros de guerra que habían sido capturados fueron conducidos a Hatti, una epidemia de peste se declaró entre los prisioneros de guerra, y comenzaron a morir. Cuando los prisioneros de guerra fueron llevados a Hatti, los prisioneros de guerra trajeron la peste a Hatti. A partir de este día, la gente muere en Hatti".
La viruela, una enfermedad que marcaba de por vida el cuerpo y rostro de quienes lograban sobrevivir a la enfermedad y sus efectos, es otra de las "
plagas" del país.
Uno de los afectados por esta fue Ramsés V, el rostro, el cuello y el pecho de su momia parecen mostrar las inconfundibles marcas de la enfermedad.
El faraón Siptah, como atestiguan las deformidades de su momia, padeció poliomielitis, un virus muy contagioso y que afecta al sistema nervioso, la capacidad motora y suele producir deformación en las extremidades. El miembro afectado era la pierna izquierda, más corta.
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